Chuck tiene que volver a la Universidad de Stanford, su álma máter de la cual fue expulsado indecorosamente, en el homecoming weekend para ayudar a un antiguo profesor, quien, como Chuck descubre, también es un operativo del gobierno buscado por un archivo altamente secreto. Chuck debe usar sus experiencias pasadas para encontrar el secreto oculto del profesor, y además descubre impactantes secretos sobre su propia vida. Lo que es más importante, Chuck descubre la verdad sobre su antiguo amigo Bryce Larkin y por qué Bryce expulso a Chuck de Stanford. Mientras tanto, Morgan tiene problemas con el nuevo director adjunto del Compra Más.