Tras la espantosa noticia, Sydney, dispuesta a acabar con todo, se dirige al SD-6 con intención de dejarlo definitivamente, pero es su padre el que le para y le hace recapacitar.
Pero algo ocurre en el SD-6, un ex-agente McKenas Cole, irrumpe y toma el control de todo, Sloane activa el bloqueo de seguridad, Jack y Sydney se quedan atrapados en el ascensor y escapan por los conductos de ventilación y descubren lo que está pasando.
Cole pretende recuperar un objeto que se encuentra en la cámara de seguridad del SD-6 para entregárselo a su jefe, al que llama "El Hombre".
Will, que dejó la investigación, recibe otra llamada de la misteriosa voz que le facilita nueva información y además la hija de McNeal, Kelly, le insiste en que continue investigando, por su padre. Will retoma las investigaciones.