Sydney se encuentra en una sala de torturas donde la fuercen a que confiese, pero ella aguanta. Mientras tanto su padre consigue inculpar a otra persona, a Russek, manipulando las pruebas. Sydney es liberada y Russek ejecutado.
Sydney es destinada a Kenia por el SD-6 a buscar a Hassan, traficante de armas, donde descubre que Hassan se ha hecho cirugía estética. Ante el temor de una posible traición de Hassan el SD-6 manda a Jack a su caza en Cuba, donde descubren que se encuentra, pero la CIA le ordena que en vez de matarlo lo capture para obtener información sobre sus compradores de armas.
Will escucha una cinta que encontró en sus investigaciones, y en ella aparece la palabra SD-6, sus pistas le llevan hasta David McNeal, un matemático encarcelado por malversación de fondos. Cuando Will visita a McNeal y éste oye las siglas SD-6, McNeal se desconcierta.