Sydney, en su intento de desentrañar lo ocurrido en los dos últimos años, acude a las celdas de CIA para interrogar a Sark. A la vez, una nueva organización terrorista, El Pacto, exige a Sark como intercambio de dos científicos que han secuestrado. Mientras tanto, Jack se enfrenta a Sloane sobre su posible responsabilidad en la desaparición de su hija, destapando así un increíble secreto.