Los efectivos de la Oficina de Proyectos Especiales, liderados por Sam y Callen, trabajan a contrarreloj en un nuevo caso: el robo de un convoy que transportaba un misil armado a un nuevo emplazamiento. Tras realizar las primeras investigaciones, los agentes descubren que el conductor del camión es un extremista islámico que trabaja en una empresa de informática. Cuando las fuerzas de seguridad localizan al sospechoso, este se suicida. Poco después, los expertos del NCIS descubren que un vídeo del hurto se ha enviado desde una de las aulas de una universidad. Kensi decide entonces infiltrarse en el campus para descubrir a los responsables del robo.