El título utilizado por el equipo para disfrazar el rodaje fue "Incident on 57th Street", el título de una canción de Bruce Springsteen.

El saludo que hacen Snape y Lockhart, y Harry y Draco, durante su sesión del Club de Duelo, es una versión modificada del saludo que se hace en la esgrima.

Alan Cumming reveló que le habían ofrecido un papel en la película, pero cuando se enteró de su agente de que Rupert Grint, con quien comparte un agente, ganaría mas dinero que negó a acepta el papel en una película en la que le pague menos que un niño actor.

Las diversas estanterías y armarios en la oficina de Dumbledore en realidad eran paredes removibles (conocidas en la industria del cine como "wild walls") que permiten que las cámaras tienen suficiente espacio para poder rodar desde varios ángulos, como el decorado, a pesar de su apariencia grandiosa, era bastante estrecho.

El interior de la estación en la película es la Cruz del Rey en el norte de Londres, mientras que el tiro exterior es en realidad St. Pancras. Las dos estaciones están una junto a la otra, pero no el mismo edificio. Esto se hizo porque la arquitectura de St. Pancras es mucho más atractiva visualmente.

Según informes, Kate Duchêne, que interpreta a la señorita Hardbroom en la serie de TV The Worst Witch (1998) se le ofreció un papel en la película, pero supuestamente se negó.

Según el país el nombre de Tom Marvolo Riddle cambia para que quede como un anagrama adecuada podría estar formado de "Yo soy Lord Voldemort." En español, se convirtió en "Tom Sorvolo Ryddle", que se transforma en "Soy Lord Voldemort." En francés, se llama "Tom Elvis Jedusor", que se convierte en "Je suis Voldemort." En holandés, su nombre es "Marten Asmodom Vilijn", que es un anagrama de "Mijn naam es Voldemort". En Turquía el nombre es "Tom Riddle Marvoldo" que constituye "Adim Lord Voldemort". En portugués brasileño el nombre es "Tom Riddle Servolo" que constituye "Eis Lord Voldemort". En danés, su nombre es "Romeo G. Detlev Jr." que constituye "Jeg er Voldemort". En italiano se llama "Tom Riddle Orvoloson", que representa el "Son io Lord Voldemort". En sueco se llama "Tom Gus Mervolo Dolder", que es el anagrama de "Ego sum Lord Voldemort".

El director Chris Columbus quería que el movimiento de la cámara fuese en forma de serpiente, lo que refleja el movimiento del basilisco en todo el castillo. Por lo tanto, algunas escenas fueron filmadas con cámaras de mano que permitió un mayor movimiento fluido de la cámara.

En las primeras escenas en las que salen las arañas, éstas son reales, luego el equipo de efectos especiales hizo el resto para crear las más grandes.

En una escena de la película, las arañas que salen son verdaderas, a raiz de ellas se configuro para ordenador el personaje de Aragog.

Una muestra del rodaje con niños y sus problemas, es la escena final cuando Hermione estrecha la mano de Ron en una señal de amistad (que será algo más en un futuro), según el guión debería haber abrazado a Ron y a Harry, pero le dio corte. Colombus cambió la secuencia y el resultado fue bastante bueno.

Hasta 14 modelos de coches fueron probados en la escena del choque contar el árbol viviente.

Emma Waton se rompió la muñeca durante el rodaje, en algunas escenas se puede apreciar, si se tiene buena vista, la escayola debajo de la túnica.

Chris Colombus acometió a la vez la pre-producción de esta película con el montaje de la primera.

Daniel Radcliffe ha cobrado 3.000.000 de euros por su participación en esta segunda parte, aunque al principio sólo le ofrecían 181.500. La mediación del sindicato de actores británicos hizo un gran favor a Radcliffe.

Hugh Grant iba a ser en un principio Gilderoy, pero al final se decantó por otra película recayendo el papel en Kenneth Branagh.