Michael Clayton (George Clooney) es un exitoso abogado de una importante firma neoyorkina, especializado en "limpiar" cualquier desaguisado que involucre a los clientes o a otros abogados de la firma. Uno de esos incidentes ocurre cuando Arthur Edens (Tom Wilkinson), otro abogado de la firma, sabotea premeditadamente un importante caso que hasta el momento iba viento en popa, una denuncia presentada contra una empresa de herbicidas que podría ser la responsable de decenas de muertes. Clayton deberá tomar entonces las riendas, pero cuanto más se involucre en el caso y más datos conozca, más le costará decidir si está en el bando correcto y si las acciones de Edens estaban plenamente justificadas.