Un niño aparece inconsciente en Sleepy Hollow, presentando una extraña enfermedad contagiosa. A juzgar por su ropa y por su forma de hablar, Crane descubre que procede de una antigua colonia que desapareció sin dejar rastro hace 400 años. Mientras, el detective Morales empieza a sospechar de Ichabod, quién ha pasado de sospechoso a colaborador del cuerpo de policía.