Tras su intento de poner fin a su colaboración con la agencia federal, Neal ingresa en prisión y su lealtad al FBI es puesta en duda. Meses después, finalizadas las tensiones con el Departamento de Justicia, Peter y Neal vuelven a trabajar juntos y su primer caso consiste en capturar a un ladrón de bancos que se hace llamar el Arquitecto, un hábil delincuente que pretende vaciar las cajas fuertes más importantes de la ciudad de Nueva York.