Kenshin Himura se ganó el apodo de "Battosai el asesino" durante la guerra. Su habilidad con la Katana era inigualable. 10 años después, los tiempos han cambiado. En la era Meiji (1978) se han prohibido las espadas y los samurais han perdido por lo que vivir. Algunos se suicidan y otros vagan por el país. Es el caso de Kenshin, quién un día descubre que alguien está matando en su nombre. Además una joven llamada "Kaoru" le acogerá en un Dojo. El principal enemigo de Kenshin será un magnate sin escrúpulos y sus séquitos.