Hacia finales de 1944, Japón estaba perdiendo la guerra y por lo tanto la partida que se jugaba en el Pacífico. El misterioso comandante Taniguchi envía al joven Hirō Onoda a una de las múltiples islas de Filipinas justo antes del inminente desembarco de Estados Unidos en el lugar. Desde los mandos del ejército japonés ya saben que van a perder, así que la verdadera misión de Onoda y de sus compañeros no es el combate en sí, sino una doctrina conocida como guerra secreta.