Ethan Hunt, respaldado por su equipo, deberá hallar, antes que caiga en las manos equivocadas, una nueva y terrorífica arma que amenaza el equilibrio mundial: una super-tecnología conocida como La Entidad, capaz de realizar vertiginosos cálculos cada milésima de segundo e infiltrarse en cualquier sistema para falsear información y convertir la realidad en dudosa.
En mitad de esta frenética lucha reaparecerá Gabriel, quien ahora trabaja para La Entidad y que está vinculado al oscuro pasado de Ethan Hunt, antes que él se incorporara al FMI.