La piloto de las Fuerzas de Autodefensa Japonesas Akane vive un encuentro decisivo cuando un nuevo Godzilla surge en Tateyama. Como respuesta, se construye un ciborg llamado Kiryu a partir de los restos del original. Sin embargo, la máquina parece albergar el alma inquieta del monstruo primigenio, mientras Akane debe aprender también a encontrar sentido y valor en su propia vida.