La familia Batman ha regresado al presente y se ha encontrado con que Japón ha desaparecido, y que una isla gigante —Hinomoto— se alza ahora en el cielo sobre Gotham City. Al frente se encuentra la Yakuza, un grupo de individuos con superpoderes que gobiernan sin honor ni humanidad y que se parecen sospechosamente a la Liga de la Justicia. ¡Ahora, depende de Batman y sus aliados salvar Gotham!