En 1980, Richard Donner dirigió buena parte de lo que luego sería Superman II antes de ser reemplazado por Richard Lester por discrepancias con los productores. El producto final fue muy distinto a lo que él tenía pensado. En 2006, Donner tuvo la oportunidad de re-montar la película según su visión, aprovechando el material rodado por él y por Lester, así como las pruebas de cámara que tenían almacenadas. Este es el resultado.
Tras salvar California en la primera entrega, uno de los misiles lanzados por Superman al espacio explota. La detonación provoca la liberación de tres fugitivos procedentes del planeta Krypton, que habían sido encerrados en una cárcel de cristal. Son el General Zod y sus secuaces, Ursa y Non, cuyo único interés es dominar el mundo. Al encontrarse en nuestro sistema solar descubrirán los poderes que nuestro Sol les confiere a los kryptonianos, y no dudarán en utilizarlos en contra de la humanidad. Mientras, Lois Lane comienza a sospechar que Clark Kent es en realidad Superman...