Todo comienza cuando un día cualquiera, Shinnosuke se encuentra con un misterioso hombre llamado Tamba, que sin saber cómo ni por qué acaba bañándose en la bañera de su casa. Todo sucede demasiado rápido y Shin chan sólo saca una cosa en claro: “Un buen baño no sólo limpia el cuerpo, también quita la suciedad del alma”.
Cuando este episodio ya está casi olvidado, aparecen en la casa de la familia Nohara unos hombres de negro. Les confiesan que se trata de la Alianza de las Aguas, una organización gubernamental encargada de garantizar la seguridad de las aguas termales. ¿Para qué necesitarán a Shin chan y a su familia? Pues nada más y nada menos que para ayudar a vencer a los Yuzame, ¡una organización terrorista que siembra el caos en el mundo!
El doctor Roña, jefe de esta banda, necesita la fuerza de la “Fuente del Lucero Dorado” para aumentar su poder. ¡Qué sorpresa se llevan los Nohara al descubrir que la fuente se encuentra cerca de su casa!
Un monstruo que tiene como objetivo conseguir el calentamiento global del planeta, un parque de atracciones en el deberán descubrir cómo funcionan las atracciones para llegar a la meta y una batalla contra la banda Yuzame, son sólo algunas de las dificultades a las que se tendrán que enfrentar.
Suerte que Tamba, el hombre misterioso, vuelve para contar que es el espíritu de las aguas termales y que concederá un deseo a los elegidos por la leyenda… ¿Gozará la familia Nohara de ese privilegio? ¿Conseguirán terminar con el doctor Roña y los Yuzame? Todo esto y mucho más en La guerra de los balnearios, ¡una aventura pasada por agua!