El Sharktopus ha sido destruido, pero la bióloga marina Lorena Christmas (Katie Savoy) descubre un huevo de la criatura y decide criarlo en el acuario de su tío. Mientras tanto, el científico Rico Symes (Robert Carradine) desarrolla una nueva abominación: el Pteracuda, un híbrido de pterodáctilo y barracuda. Todo se descontrola cuando el Pteracuda escapa, convirtiéndose en una amenaza letal por tierra, mar y aire. La única esperanza para detenerlo es liberar al Sharktopus y enfrentar a ambos monstruos en un enfrentamiento épico.