La película basada en la serie "Mystery Science Theater 3000" sigue el mismo espíritu humorístico y absurdo que hizo famosa a la serie. La trama gira en torno a un ser humano, Mike Nelson, y sus dos robots compañeros, Crow T. Robot y Tom Servo, quienes están atrapados en una nave espacial y obligados a ver malas películas terrestres. Este "experimento" es parte del plan del malvado Dr. Forrester, quien intenta conquistar el mundo embotando las mentes de los espectadores al hacerlos ver películas de baja calidad. A lo largo de cada sesión de cine forzado, vemos la silueta de Mike y los robots en el borde de la pantalla, bromeando sin parar, burlándose de los momentos ridículos y de los defectos de cada escena, lo que convierte la experiencia en una mezcla entre cine y comedia. Para la versión cinematográfica, el filme elegido fue *This Island Earth* (1954), un clásico de ciencia ficción que, aunque no era tan malo, fue igualmente blanco de los comentarios y el humor mordaz de los personajes.