En lo alto de una fortaleza secreta en la cima de una montaña se encuentra la Liga de las Sombras, liderada por el audaz Ra's al Ghul y su peligrosa hija, Talia. Desde allí, supervisan un ejército de asesinos entrenados con la misión de lograr la dominación mundial. Sin embargo, un levantamiento dentro de la Liga amenaza con desequilibrar el poder y obliga a Talia y a su joven hijo, Damian, a huir a Gotham. Perseguidos por asesinos, Talia busca protección en Batman, quien, sin saberlo, es el padre de Damian.

Mientras asume la inesperada responsabilidad de su hijo, Batman se enfrenta al letal Deathstroke y a la Liga de las Sombras, al mismo tiempo que intenta enseñarle a Damian que combatir el crimen no significa convertirse en un criminal. Con el apoyo de los aliados más confiables de Gotham, como el Comisionado Gordon y Nightwing, Batman descubrirá que su hijo es, al mismo tiempo, el aliado en quien más puede confiar.