Un hombre llamado John Murdoch despierta una noche en una habitación de hotel sin recordar nada de su pasado. Junto a él hay una mujer asesinada y unas pocas pistas que le conducen a un pueblo junto al mar al que es imposible llegar en la ciudad eternamente a oscuras en la que se encuentra. Mientras huye de las autoridades, que lo buscan como autor de una serie de crímenes que él está seguro de no haber cometido, intenta descifrar su identidad y recuperar la vida que ha perdido. Mientras tanto, unos misteriosos hombres de negro, ayudados por un excéntrico científico, intentan capturarle para averiguar por qué es capaz de resistirse a los poderes con los que controlan la ciudad oscura...