El ancestral reino sumergido de Mu ha estado recolectando energía del centro de la Tierra. Su reina decide emerger a la superfície para conquistar el mundo, utilizando una serie de terremotos. La única esperanza humana es el Capitán Shinguji y su submarino nuclear Atragón. En un principio, el Capitán no desea involucrarse, pero tras el rapto de su hija y el novio de ella por el Reino de Mu decide dar todo lo posible.