Tohno Takaki y Shinohara Akari son amigos cercanos que después de la graduación de su escuela primaria tienen que separarse debido a una mudanza por parte de sus familias. Son los profundos sentimientos que sienten el uno por el otro lo que los mantiene en contacto, pero aun así temen que no podrán volver a verse. Entonces, un día, Tohno decide visitar a Akari...

Esta es un película que se divide en tres partes ('Okasho', 'Cosmonaut' y 'Byosoku 5 centimeter'), siguiendo los pensamientos y la relación de dos jóvenes que se encuentran, y parte desde su punto de vista y la gente que se encuentra a su alrededor.