En el año 1865, durante el sitio de Richmond, en el estado de Virginia, un grupo de prisioneros sudistas logra escapar a bordo de un globo. Sin rumbo y en medio de una gran tormenta, llegan a una isla desconocida a más de seis mil millas de distancia. Su primer paso es sobrevivir y explorar la isla, para saber si existe alguna clase de vida.
Pronto aparece en su ayuda el Capitán Nemo, un excéntrico personaje que habita el lugar donde ha creado un milagro tecnológico: el nautilus.