1- Ya en el primer capítulo dejan claro muchas cosas (Locke explicando a Walt, casualidades de la vida, el mismo personaje que Jacob quería en un principio como sustituto, las reglas del Backgammon ("Dos bandos. Dos jugadores, Uno blanco. Otro negro") es una clara referencia a las dos entidades enfrentadas en la isla.
2- En uno de los primeros (2 ó 3, no estoy seguro) Locke habla de que ha "visto el corazón de la isla". Podemos interpretarlo de muchas maneras, pero está claro que hace referencia a lo que vimos de la isla posteriormente.
3- Jack encuentra los dos cadáveres de Madre y el Hombre de Negro (los famosos Adán y Eva) con ambas piedras (blanca y negra), otro punto a favor de la lucha de Jacob y el Hombre de Negro.
4- Ya en los primeros capis vemos las apariciones del Monstruo de Humo, en varias formas (como monstruo y como el padre de Jack, por ejemplo) y del juego mental que comienza entre los candidatos.
5- En muchos capítulos a lo largo de la serie vemos que John Locke dice que es "especial" o que está predestinado a hacer algo grande. Es una insinuación de su papel como candidato (número 4) y de su posterior muerte y resurrección como el nuevo hombre de negro, el cual le dijo a su Madre, y Madre se lo dijo a el, que era "especial".
6- El papel de lider de Jack tan definido en el principio de la serie. Posteriormente, Jack será el primer candidato en tomar el relevo de Jacob.
Esto hasta donde llevo visto. Luego a lo largo de la serie vemos muchas cosas más:
1- Lo primero, está claro, el tema de los números en la segunda temporada (4, 8 15, 16, 23, 42). Los números asignados a cada candidato "principal". Y digo principal porque en la isla hubo más candidatos (Boone Carlyle tenía en número 220, Juliet Burke el 58, Kate Austen el 51, incluso Rousseau (nº 20), Faraday, Charlotte tenían sus números. Miradlos en el capítulo del Faro...) lo que explica su presencia y relevancia en la isla (así como la muerte "accidental" de Boone, o la de Charlotte o Faraday). Y el monstruo de humo no mató por su mano a ninguno de ellos (Acordaos de sus reglas: no podían matarse entre ellos, y el monstruo no podía matar a ninguno). Así, ¿por qué algunos candidatos mueren, otros se largan u otros, sencillamente, son tachados de la lista de Jacob?
Cada candidato tiene tres opciones:
No hacer nada y ver cómo salen las cosas (libre albedrío), pero como consecuencia posiblemente su nombre será tachado.
Asumir el papel de protector de la isla y relevar a Jacob en la tarea.
Abandonar la isla con él.
La lista completa:
http://es.lostpedia.wikia.com/wiki/Candidatos2- Los candidatos no saben nada de Jacob, la isla, la lucha de poder...cuando los Otros se los llevan porque, como dijo Jacob en uno de los capítulos de la última temporada, no puede decirse a nadie como actuar, ya que no sirve de nada si se tiene que decir a la gente cómo actuar bien (palabras del propio Jacob), ya que cada candidato está a prueba durante el tiempo que permanece en la isla. Según sus actos, será eliminado o irá pasando las pruebas que vaya pasando.
3- Las apariciones de familiares y amigos fallecidos o desaparecidos a los supervivientes del vuelo Oceanic 815 que aparecen durante toda la serie se explican por las apariciones del Hombre de Negro por crear el caos y la confusión entre los candidatos.